Orijinal Deus Ex'te müzisyen olarak hizmet vermiş ve bazı seslerde katkıda bulunmuş olan Alexander Brandon, oyunun devresi olan Deus Ex: Invisible War'da ses yönetmenliği görevine getirildi. Oyunda uzun süredir tartışmalı kalan bu ikinci oyun, Brandon'un ilk ses yönetmenliği deneyimi oldu. PC Gamer'ın Wes Fenlon'a verilen bir röportajda Brandon şöyle dedi: "Gelişim için yer vardı, böylece söyleyeceklerim var.
" Ancak ekibin çalışmaları hakkında memnuniyet duyduğunu belirtti: "İçerik açısından, gerçekten iyi yaptığımızı düşünüyorum. Ana themamın konusunda mutluyum. Şimdi evvelimiz olan bir kavuşturmacısı da bu themaya sesler ekledi ve harika bir iş çıkardı.
Ben de daha fazla özgürlük elde edip, temamalı, melodik şeyler ifade etmek için izin alındım, olsa bile orijinal ana themaya göre sessizce durdu. O zamanın herkesin sevdiği '90lar stili kiberpunk Johnny Mnemonic çilek festi' değildi." Invisible War'un en güçlü alanlarından biri de koalisyonlardır.
Oyuncular bunlardan birkaçıyla katılabilir, onları terk edebilir ve birbirleriyle rekabet edebilirler. Her biri kendi hava sahibiydi ve daha karmaşık hikayeyi anlatmak için basitleşmiş sistemler kullanıldı. "Daha yüksek kalitede olacağız ve hikaye çok daha karmaşık olacaktır," dedi Brandon.